Sorry, hatte nur die Überschrift gelesen.
Meine Erfahrung mit rpmorphan aus der Vergangenheit:
Es bietet Dir Dateien als scheinbar zu löschen an, die aber von anderen Programmen gebraucht werden.
Für mich ein Grund davon dann die Finger gelassen zu haben.
Ansonsten ruf es auf der Konsole auf; die GUI ist jetzt auch nicht weltbewegend anders.