Es ist schlicht so, dass so ein Packman ziemlich viele Pakete hat.
Kommt nun eine etwas größere Welle an Updates, so ist nicht sichergestellt, dass jederzeit alle Pakete auf demselben Stand sind und jeder wirklich immer das Gleiche sieht.
Zudem passieren öfter mal menschlich bedingte Fehlerchen.
Und das syncen von Mirrors braucht auch seine Zeit.
Der eigentliche Syncjob ist letztlich durch den Betreiber des Servers selbst gesteuert.
Basteln die mal an einem Problemchen, kann es gut sein, dass da mal ein Mirror völligen Unsinn bietet.
Er wird halt dann einige Zeit out-of-sync sein.
Also einfach ignorieren, ein Bier trinken, mit der Bedienung flirten und am nächsten Tag frisch auf an's Werk.