Wenn es Pakete mit gleicher Versionsnummer gibt, wird es aus dem Repo installiert, das die höhere Priorität (also niedrigere Nummer) hat.
Ein zypper up (UPdate) macht nur Updates, wechselt für ein Paket aber nie das Repo, egal um wieviel neuer in einem anderen Repo die Version dort sein möge.
Ein zypper dup (DistributionUPgrade) würde ein Paket einfach auf das Repo umstellen, das die höchste Version bietet.
Da man das meist nicht radikal für alle Pakete möchte, restriktiert man das mit --from <someRepo> auf genau das Repo, das man meint. (Und legt indirekt auch fest, dass man die Pakete auf jeden Fall aus diesem Repo will, auch wenn in anderen.....)