Ich hoffe nicht, dass es Kompatibilitätsprobleme mit den verschiedenen Versionen gibt.
Wir haben aber noch eine Möglichkeit.
TB beenden (Fenster schließen).
Lösche unter .thunderbird alles - außer den Ordner 3b18zOhs.default
In der Konsole gibst du dann ein:
thunderbird --ProfileManagerCreate Profile - Next - Choose Folder - und dort 3b18zOhs.default angeben.
Fertigstellen - speichern - TB mit markiertem, neuen Profil starten und Daumen drücken.
Gib mir 5 Min.
Ich stelle es gerade hier auf einer VM nach.
Wie groß ist eigentlich der Ordner 3b18zOhs.default?
Bin soweit und sieht hier gut aus...
Eine Sache vorher:
1. Poste einmal den absoluten Pfad zu .thunderbird:
Beispiel bei mir:
/home/sterun/.thunderbird/
2.Kopiere den Ordner 3b18zOhs.default auf deinen Schreibtisch (Desktop)
Danach geht es direkt weiter 
Konsole (immer als user - nicht als Root):
thunderbird --ProfileManager
Ziel ist, dass im ProfileManager alles gelöscht wird:
Delete Profile und löschen - auch Häkchen setzen, dass alle Daten gelöscht werden.
Exit
Wieder Konsole:
thunderbird --ProfileManager
Jetzt sollte NICHTS mehr dort enthalten sein - ansonsten ALLES löschen.
Jetzt muss der Order 3b18zOhs.default wieder nach .thunderbird kopiert werden.
Create Profile - Next - neuer Name kann belassen werden (Default User)
Choose Folder - unten diesen Pfad eingeben:
/home/wolfgang/.thunderbird/3b18zOhs.default
Finish - Häkchen muss unten gesetzt sein (use the selected...)
Start thunderbird
PS:
Sollte es noch immer nicht laufen, so hat es vermutlich damit zu tun, dass auf dem Windows 7 eine portable Version von Tunderbird läuft.
Dann sehe ich nur die Möglichkeit, auf dem Windows eine "richtige" Thunderbird-Version zu installieren, um dann das Profil auf dein Linux zu übertragen.