So, ich konnte das Problem lösen. Wie ich schon vermutete war es baloo, ein Dateiindizierer.
Quelle:Baloo › Wiki › ubuntuusers.de
Leider immer noch hohe CPU-Auslastung und LED-Geblinke.
War's wohl auch nicht, trotzdem ne witzige Meldung.
Endlich, alles schön ruhig, kein Geblinke, keine CPU-Auslastung mehr. System reagiert auch viel schneller. Und das Wichtigste, seit 1,5 Stunden kein Absturz mehr.
Danke nochmal für die Hilfe. Ich denke, den Thread kann man schließen.