Hab das Problem selber beheben können.
Der Schalter im Programm "Gnome-Tweak" - "Have filemanager handle the desktop" hat das Problem verursacht. Der scheint wohl nicht richtig zu funktionieren. Hatte einen neuen Benutzer angelegt um zu schauen ob das Problem auch bei ihm besteht und dort ist Nautilus ohne Probleme gestartet. Dann hab ich ich einfach mal diverse Stellen in den Einstellungen verglichen und dort ist mir aufgefallen das der oben genannte Schalter Symbole auf dem Desktop anzeigt, was bei meinem Problem-Profil nicht der Fall war.
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mfg
K-Mille-T