Zuerst solltest Du mal die Prioritäten Deiner Repositories vernünftig einstellen.
So wie die im Moment eingestellt sind, ist das, gelinde gesagt, unvorteilhaft.
Repository 4 kannst Du entfernen, da Du ja das passende KDE 49 Extra Repository (#2) verwendest.
Repository 12 (Installationsmedium) kannst Du deaktivieren, da das alles im OSS Repository enthalten ist.
Bei den deaktivierten Repositories kannst Du die automatische Aktualisierung abstellen, da das dann auch nicht wirklich Sinn macht.
Hast Du bei der Umstellung auf KDE 4.9 auch die installierten Pakete von Repository 4 auf Repository 2 umgestellt?
Dann solltest Du mal gucken, ob rawtherapee vielleicht ufraw bzw dcraw zum korrekten Funktionieren benötigt.
Wenn Du dann Deine Liste aufgeräumt hast, poste nochmal die Ausgabe von
Die Ausgabe von
hast Du übrigens noch vergessen.