Du kannst zwar generell von openSUSE 11.3 auf 12.1 upgraden,
indem du die entsprechenden Repos änderst,
beim Upgraden solltest du aber wie ich hier lese, Packman deaktivieren.
Empfehlen würde ich dir eine Neuinstallation.
Durch ein Upgrade würden die anderen OS unberührt bleiben.
Bei einer neuinstallation müsstest du eben die Partitionen von openSUSE 11.3 überschreiben.
Evtl. wählt das yaST bei der Installation automatisch aus, wenn nicht musst du es manuell festlegen.