schon komisch daß ich die systemeinstellungen für den user und root synchron halten muss, damit sie beim user greifen. das hatte ich auch bei dem wechsel des SDDM Anmeldebildschirms, wo ich ein anderes Wallpaper rein gemacht habe. Wahrscheinlich liegt das an der permission.secure regel
Ist nicht nötig.
Die Einstellungen des Users root (ist auch nur ein User) liegen in /root, die Einstellungen des Users NAME liegen in /home/NAME.
Hat nichts miteinander zu tun.
Sobald du in den Systemeinstellungen als User NAME etwas änderst und kein root-Passwort abgefragt wird, landet es in /home/NAME.
PS:
Die grafische root-Anmeldung in sddm sollte eigentlich ausgeschaltet sein...