Das Vorgehen wie oben skizziert führt zum gewünschten Erfolg (Problem mit Threema bleibt, aber dazu mache ich ggf. noch einen separaten Thread), ich schließe dies jetzt. Nochmals vielen Dank an alle!
Threema hat auch bei mir gezickt, daher habe ich die ch.threema.threema-web-desktop flatpak-App gelöscht und dann die Beta-Version von Threema 2.0 für Desktop genommen
$ flatpak install --from https://releases.threema.ch/flatpak/threema-desktop/ch.threema.threema-desktop.flatpakrefdie lief problemlos.
Es läuft! Auch für diesen Hinweis vielen herzlichen Dank, Luigi!