Das sieht nach Hardware-Problem aus. Anscheinend ist die Grafikkarte schuld: Temperatur vom Chip oder Grafikspeicher.
Zum Testen kannst Du eine 3D-Anwendung starten und schauen, ob diese grafische Artifakten aufweist oder gar einfriert. (z.B. Sauerbraten Cube 2 o.ä.)
GNOME verwendet nicht viel durchsichtige Texturen zum Rendern von der Oberfläche, deswegen kommt es anscheinend nur bei KDE zu Problemen.