Das zeigt dir aber auch Pakete wie z.B skype, google-earth, teamviewer usw an, wenn diese an der Paketverwaltung vorbei installiert wurden.
Wurden diese aus einem lokal angelegten Repository installiert, werden diese natürlich dann nicht angezeigt, da der Befehl nur Pakete anzeigt, die keinem Repository zuzuordnen sind.
dagegen zeigt, wenn ich das richtig verstanden habe, nur die Pakete an, die keine anderen Abhängigkeiten haben.
Das bedeutet aber auch nicht, dass man die bedenkenlos löschen sollte, da hier durchaus Programme bzw Pakete dabei sein könnten, die man noch braucht.