SELinux ist ein ziemlich grundlegende Zugriffsteuerung, die Dateizugriffe der Programme steuert und eingrenzt. Und das ist SEHR wichtig, sobald User im Spiel sind, die auf ihren Maschinen Quatsch anstellen und Dinge installieren, und nicht wissen, was sie tun.
In kurz: Nein, deaktivieren ist nicht sinnvoll, troubleshooten und SLELinux Einstellungen vornehmen (lernen) ist sinnvoll.
Ich hatte bis jetzt 2 Fälle, in +10 Jahren, wo 1x Apparmor und 1x SELinux den Start einer App blockiert haben. Ersteres war ein Ubuntu-Bug, und das zweite war eine gut gemeinte Default Einstellung von Tumbleweed (Keine Steam games starten mit GE-Proton)
Wenn man aber ein Purist ist, und z.B. ein Arch zu Fuß installiert und nur genau das installiert, was man benötigt und keine AUR Pakete benutzt, dann kann man vielleicht auf SELinux/Apparmor verzichten.